Многофункциональный комплекс Амальтея располагается на территории инновационного центра Сколково, рядом с Минским и Можайским шоссе, в 3 км от МКАД, в нескольких сотнях метрах от железнодорожной платформы Сколково. В состав МФК Амальтея входят четыре построенных здания общей, которые объединены между собой крытой пешеходной торговой галереей.